Ser una organización líder, transparente, confiable, honesta e innovadora en la conservación de la biodiversidad acuática, que coadyuve en la formación de una cultura de la sustentabilidad dentro de la sociedad para lograr inculcar valores ambientales que permitan reconocer la importancia de los recursos acuáticos y de su trascendencia en el desarrollo de sociedades sustentables. Lo anterior se logrará a través de la colaboración con instancias de los tres niveles de gobierno, así como también de instituciones nacionales y extranjeras como son universidades, centros de investigación y distintos sectores de la sociedad civil. Se promoverán las acciones de educación, entrenamiento, capacitación, asistencia técnica, formulación de estudios y proyectos, gestionando o proporcionando recursos para lograr la conservación, manejo, el uso sustentable de las especies y derivados de la biodiversidad acuática.